En el actual contexto político organizativo, económico, social y cultural, la Coordinadora Rural, en el seguimiento de sus objetivos, busca posicionar a su población meta, implementando estrategias para facilitar los procesos de participación, articulación y empoderamiento de las familias campesinas, los pequeños(as) productores(as), las organizaciones campesinas, los líderes y las lideresas, en la elaboración y negociación de propuestas  para el desarrollo rural andino y de la pequeña producción, que involucre la concentración y participación de fuerzas motrices, germinadas, en la propia población campesina.

En este contexto, la Coordinadora Rural ha previsto en su Programa General de Acción 2006-2008 promover el fortalecimiento de capacidades institucionales regionales en intercambio y sistematización de experiencias; cuya particularidad además de ser un proyecto institucional, nos plantea una modalidad de ejecución distinta a la de implementación de pequeños  proyectos por objetivos, pasando ahora a una ejecución conjunta de un proyecto nacional, con el propósito de focalizar los temas y objetivos a alcanzar en el trienio; concentrándose en el Plan Operativo Anual (POA) 2006, que inicia la ejecución del PGA 2006-2008.
 
De este modo, el principal reto de la CR en el presente año es la culminación de la elaboración de la Agendas Agrarias Andinas regionales, y su inserción en los espacios de concertación, involucrando actores sociales regionales y nacionales diversos en la construcción de espacios en los cuales se proponga cambios en las políticas agrarias, que estimulen la capacitación, el desarrollo y la aplicación de la ciencia y la tecnología, para hacer del sector agrario una actividad competitiva. Para ello la CR se involucra en promover y estimular la formación y fortalecimiento (o consolidación) de las organizaciones agrarias.
La sistematización de las experiencias agrarias constituyen un inter aprendizaje a fin de mejorar el potencial político de las agendas agrarias, que concentran las propuestas concertadas para el desarrollo socioeconómico rural y lograr la incidencia en políticas públicas.

Otro de nuestros retos institucionales, es abrir un camino de promoción y desarrollo de negocios rurales exitosos a partir de la identificación de oportunidades de negocios, sea de productos y servicios con demanda de mercado comprobada y otros nuevos que requieren ser ofertados por sus especiales características, en una lógica de cadena productiva; que estimule el grado de organización entre los productores, en una lucha contra la fragmentación y dispersión de las fuerzas productivas bases para el desarrollo.